{"id":928,"date":"2017-05-07T17:17:14","date_gmt":"2017-05-07T20:17:14","guid":{"rendered":"http:\/\/sbbd.org.br\/2017\/?page_id=928"},"modified":"2017-05-07T17:20:12","modified_gmt":"2017-05-07T20:20:12","slug":"dbbio","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/sbbd.org.br\/2017\/index.php\/dbbio\/","title":{"rendered":"Workshop Databases meet Bioinformatics"},"content":{"rendered":"

Workshop Databases meet Bioinformatics<\/strong>
\nhttps:\/\/www.sbc.org.br\/sbbd\/2017\/dbbio<\/a><\/p>\n

 <\/p>\n

Nos \u00faltimos anos, tem havido uma revolu\u00e7\u00e3o no modo como a pesquisa em biologia \u00e9 realizada. Tais pesquisas s\u00e3o impulsionadas principalmente pelo uso intensivo de recursos computacionais. Esta \u00e1rea de pesquisa da biologia que depende de recursos computacionais \u00e9 chamada de bioinform\u00e1tica, que aplica m\u00e9todos quantitativos para a an\u00e1lise de sistemas biol\u00f3gicos. Como uma das grandes quest\u00f5es da biologia \u00e9 decifrar a informa\u00e7\u00e3o gen\u00f4mica do ser humano (ou de qualquer organismo), os bi\u00f3logos podem trabalhar com v\u00e1rios tipos de dados que s\u00e3o coletados sistematicamente de toda a comunidade de pesquisa biol\u00f3gica. Desta maneira, podem ser constru\u00eddos modelos que expliquem como os genes trabalham juntos em cada genoma ou inferir as fun\u00e7\u00f5es bioqu\u00edmicas que realizam. Novos m\u00e9todos laboratoriais de alto rendimento, tais como o microarranjos de DNA ou o Sequenciamento de Nova Gera\u00e7\u00e3o (NGS), produzem v\u00e1rios formatos de dados gen\u00f4micos e grandes matrizes de valores que descrevem os n\u00edveis de express\u00e3o g\u00eanica, intera\u00e7\u00f5es prote\u00edna-prote\u00edna e outras informa\u00e7\u00f5es sobre como genes e prote\u00ednas interagem na vida celular.<\/p>\n

A pesquisa biol\u00f3gica tornou as estrat\u00e9gias de integra\u00e7\u00e3o de dados cruciais para os avan\u00e7os e descobertas em uma infinidade de campos como a gen\u00f4mica, prote\u00f4mica, metagen\u00f4mica, transcript\u00f4mica, metabol\u00f4mica, ci\u00eancias ambientais e pesquisas cl\u00ednicas. A bioinform\u00e1tica, relacionada ao armazenamento de dados e a an\u00e1lise de sequ\u00eancias do genoma, precisa que abordagens computacionais sejam inclu\u00eddas no desenvolvimento da pesquisa biol\u00f3gica, melhorando a automa\u00e7\u00e3o, coleta e a minera\u00e7\u00e3o de dados. Este fato pode levar \u00e0 descoberta de novos modelos sobre fun\u00e7\u00f5es de sistemas biol\u00f3gicos e da vida evolutiva das esp\u00e9cies.
\nO compartilhamento, integra\u00e7\u00e3o e anota\u00e7\u00e3o de dados s\u00e3o essenciais para assegurar a reprodutibilidade das an\u00e1lises e a interpreta\u00e7\u00e3o dos resultados experimentais. Logo, os bioinformatas e cientistas da computa\u00e7\u00e3o t\u00eam de somar experi\u00eancias e interagir com bi\u00f3logos experimentais para permitir a integra\u00e7\u00e3o de dados como um sistema biol\u00f3gico. Este \u00e9 um aspecto chave que contribui para o sucesso e as futuras orienta\u00e7\u00f5es na investiga\u00e7\u00e3o multidisciplinar.
\nPor exemplo, os bioinformatas devem representar dados de v\u00e1rios sistemas ou bases de dados biol\u00f3gicas; por outro lado, realizar consultas complexas sobre esses dados pode ser apoiado por especialistas em bancos de dados. De fato, as t\u00e9cnicas de banco de dados existentes e relevantes aplicadas \u00e0s pesquisas na bioinform\u00e1tica podem incluir um modelo de dados rigoroso, otimiza\u00e7\u00e3o baseada em custo, linguagens de consulta declarativa, independ\u00eancia de dados f\u00edsicos e l\u00f3gicos, os quais devem ser aplicados a novos tipos de dados biol\u00f3gicos a serem gerados por bi\u00f3logos moleculares. Mas muitas dessas t\u00e9cnicas t\u00eam sido apenas minimamente exploradas na comunidade da bioinform\u00e1tica.
\nNo Brasil, existem v\u00e1rias iniciativas para fomentar a bioinform\u00e1tica, como a Rede Brasileira de Bioinform\u00e1tica (RNBio), criada em janeiro de 2014 como resultado de um Programa de Estrutura\u00e7\u00e3o do Minist\u00e9rio da Ci\u00eancia, Tecnologia, Inova\u00e7\u00e3o e Telecomunica\u00e7\u00f5es (MCTIC) destinado a fortalecer pesquisas envolvendo o uso da bioinform\u00e1tica no Brasil. A miss\u00e3o da rede RNBio \u00e9 fomentar o desenvolvimento de projetos de pesquisa em diversas \u00e1reas da biologia computacional, por exemplo, em estudos envolvendo sequenciamento de genomas, an\u00e1lise de transcript\u00f4mica e prote\u00f4mica, biologia de sistemas e estudos de interactoma.
\nOs requisitos emergentes das aplica\u00e7\u00f5es de bioinform\u00e1tica oferecem novas oportunidades de acoplamento de pesquisas sendo realizadas pelas comunidades de banco de dados e de bioinform\u00e1tica, brasileira e internacional.<\/p>\n

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T\u00d3PICOS DE INTERESSE<\/strong><\/p>\n

Os t\u00f3picos de interesse do SBBD DBBio incluem (mas n\u00e3o est\u00e3o limitados a) os listados a seguir:<\/p>\n

– Fundamenta\u00e7\u00e3o e aplica\u00e7\u00e3o pr\u00e1tica para a integra\u00e7\u00e3o de Bioinform\u00e1tica e Banco de Dados;
\n– Modelagem, implementa\u00e7\u00e3o e integra\u00e7\u00e3o de bancos de dados biol\u00f3gicos;
\n– Suporte computacional guiado por dados em \u00e1reas da Bioinform\u00e1tica da como an\u00e1lise de sequ\u00eancias, montagem de genomas, metagen\u00f4mica, transcript\u00f4mica, metabol\u00f4mica, prote\u00f4mica, filogen\u00f4mica, bioinform\u00e1tica estrutural e processamento de informa\u00e7\u00f5es para an\u00e1lise estat\u00edstica;
\n– Modelos de dados para Bioinform\u00e1tica;
\n– Integra\u00e7\u00e3o de dados em Bioinform\u00e1tica;
\n– Bancos de dados distribu\u00eddos em Bioinform\u00e1tica; e
\n– T\u00e9cnicas de Web sem\u00e2ntica aplicadas em Bioinform\u00e1tica.<\/p>\n

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SUBMISS\u00d5ES<\/strong><\/p>\n

Ser\u00e3o aceitas submiss\u00f5es no formato da SBC (https:\/\/www.sbc.org.br\/documentos-da-sbc\/category\/169-templates-para-artigos-e-capitulos-de-livros<\/a>): artigos t\u00e9cnicos completos, escritos em portugu\u00eas, ingl\u00eas ou espanhol, ter entre seis (6) p\u00e1ginas e oito (8) p\u00e1ginas e serem submetidos via JEMS (https:\/\/jems.sbc.org.br\/home.cgi?c=2844<\/a>).<\/p>\n

Todas as submiss\u00f5es ser\u00e3o revisadas de acordo com os seguintes crit\u00e9rios: adequa\u00e7\u00e3o ao escopo do workshop, relev\u00e2ncia, qualidade t\u00e9cnica, originalidade e clareza. Artigos que descrevam trabalhos preliminares e em andamento tamb\u00e9m poder\u00e3o ser submetidos. Resultados s\u00e3o desej\u00e1veis, mas n\u00e3o necess\u00e1rios. Os artigos devem possuir uma se\u00e7\u00e3o descrevendo trabalhos relacionados. Os artigos ser\u00e3o revisados por pares, e a publica\u00e7\u00e3o dos trabalhos aceitos \u00e9 condicional \u00e0 inscri\u00e7\u00e3o no SBBD e a apresenta\u00e7\u00e3o oral de um dos autores durante o workshop.<\/p>\n

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DATAS IMPORTANTES<\/strong><\/p>\n

– Prazo final para a submiss\u00e3o de trabalhos: 15-julho-2017
\n– Notifica\u00e7\u00e3o preliminar de aceita\u00e7\u00e3o com sugest\u00e3o de corre\u00e7\u00f5es: 16-agosto-2017
\n– Prazo para entrega da vers\u00e3o final: 23-agosto-2017
\n– Workshop DBBio a ser realizado junto ao SBBD 2017: 02 e 05 de Outubro de 2017. Uberl\u00e2ndia, MG<\/p>\n

* Ser\u00e3o inclu\u00eddos na programa\u00e7\u00e3o definitiva e publicados apenas os trabalhos com vers\u00e3o final entregue, pelo menos um coautor j\u00e1 inscrito no evento e com termo de cess\u00e3o de direitos \u00e0 SBC devidamente assinado.<\/p>\n

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COORDENA\u00c7\u00c3O GERAL<\/strong><\/p>\n

Kary Oca\u00f1a \u2013 LNCC\/RJ (karyann@lncc.br)<\/p>\n

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COMIT\u00ca DE PROGRAMA (em forma\u00e7\u00e3o)<\/strong><\/p>\n

– Alexandre Lima (COPPE\/UFRJ)
\n– Ary Henrique Oliveira (UFT)
\n– Daniel de Oliveira (UFF)
\n– Fabio Andre Porto (LNCC)
\n– Fernanda Bai\u00e3o (UNIRIO)
\n– Fernanda Campos (UFJF)
\n– Glauber Wagner (UFSC)
\n– Guilherme Loss (LNCC)
\n– Helena Cristina Gama Leit\u00e3o (UFF)
\n– Jonas Dias (EMC Corporation)
\n– Joseane Biso de Carvalho (LNCC)
\n– Kary Oca\u00f1a (LNCC), chair
\n– Luis Pacheco Arge (LNCC)
\n– Luiz M. R. Gadelha Jr. (LNCC)
\n– Marcos Catanho (FIOCRUZ)
\n– Marta Mattoso (COPPE\/UFRJ)
\n– Regina Braga (UFJF)
\n– Sergio Lifschitz (PUC-Rio)
\n– Sergio Manuel Serra da Cruz (UFRRJ)<\/p>\n

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